| 1 kolo | 11.07.2016 | El Soferino Escuadra | - | FC Foncorda | 0 | : | 1 |
| 1 kolo – PB | 12.07.2016 | FC Kuliškovci | - | FC Foncorda | 0 | : | 4 |
| 2 kolo | 13.07.2016 | FC Foncorda | - | Herci | 1 | : | 1 |
| 2 kolo – PB | 14.07.2016 | FC Foncorda | - | FC Molér Geár | 4 | : | 0 |
| 3 kolo | 15.07.2016 | FC Hostovice | - | FC Foncorda | 0 | : | 1 |
| 4 kolo | 18.07.2016 | FC Foncorda | - | Bumperi PSA | 2 | : | 0 |
| 3 kolo – PB | 19.07.2016 | FC Notor Hejnice | - | FC Foncorda | 1 | : | 2 |
| 5 kolo | 20.07.2016 | Rýchla Rota | - | FC Foncorda | 2 | : | 1 |
| 2 kolo – NP | 21.07.2016 | FC Foncorda | - | TJ Střelná | 9 | : | 0 |
| 6 kolo | 22.07.2016 | FC Foncorda | - | starí páni | 0 | : | 1 |
| 7 kolo | 25.07.2016 | FC Foncorda | - | FC Baníček | 2 | : | 2 |
| 4 kolo – PB | 26.07.2016 | Dynamo Moskva | - | FC Foncorda | 1 | : | 3 |
| 8 kolo | 27.07.2016 | 1.FK Hlubák Smíchov | - | FC Foncorda | 1 | : | 1 |
| 3 kolo – NP | 28.07.2016 | FC Foncorda | - | MŠK B.Bystrica | 2 | : | 0 |
| 9 kolo | 29.07.2016 | FC Foncorda | - | FK Dvorany | 0 | : | 3 |
| 10 kolo | 01.08.2016 | FC Notor | - | FC Foncorda | 2 | : | 2 |
| 5 kolo – PB | 02.08.2016 | FC Foncorda | - | MC AuMa Hýsli | 0 | : | 0 |
| 11 kolo | 03.08.2016 | FC Foncorda | - | MŠK B.Bystrica | 1 | : | 1 |
| 4 kolo – NP | 04.08.2016 | FK Studienka | - | FC Foncorda | 1 | : | 7 |
| 12 kolo | 05.08.2016 | Slavoj Sereď | - | FC Foncorda | 0 | : | 2 |
| 13 kolo | 08.08.2016 | FC Foncorda | - | Hviezda | 5 | : | 0 |
| 6 kolo – PB | 09.08.2016 | TJ Ostravští Chachaři | - | FC Foncorda | 0 | : | 5 |
| 14 kolo | 10.08.2016 | FC Lozorno | - | FC Foncorda | 1 | : | 0 |
| 1/8 – NP | 11.08.2016 | FC Foncorda | - | 1.FK Hlubák Smíchov | 0 | : | 1 |
| 15 kolo | 12.08.2016 | FC Foncorda | - | AFK Pečky | 0 | : | 0 |
| 16 kolo | 15.08.2016 | FC Foncorda | - | El Soferino Escuadra | 2 | : | 2 |
| 7 kolo – PB | 16.08.2016 | FC Foncorda | - | Besiktas JK | 2 | : | 0 |
| 17 kolo | 17.08.2016 | Herci | - | FC Foncorda | 3 | : | 0 |
| 18 kolo | 19.08.2016 | FC Foncorda | - | FC Hostovice | 2 | : | 2 |
| 19 kolo | 22.08.2016 | Bumperi PSA | - | FC Foncorda | 0 | : | 2 |
| 1/16 – PB | 09.08.2016 | FC Bayern 1982 | - | FC Foncorda | 2 | : | 0 |
| 20 kolo | 24.08.2016 | FC Foncorda | - | Rýchla Rota | 2 | : | 2 |
| 1/16 – PB | 09.08.2016 | FC Foncorda | - | FC Bayern 1982 | 1 | : | 1 |
| 21 kolo | 26.08.2016 | starí páni | - | FC Foncorda | 5 | : | 0 |
| 22 kolo | 29.08.2016 | FC Baníček | - | FC Foncorda | 0 | : | 1 |
| 23 kolo | 31.08.2016 | FC Foncorda | - | 1.FK Hlubák Smíchov | 0 | : | 1 |
| 24 kolo | 02.09.2016 | FK Dvorany | - | FC Foncorda | 4 | : | 0 |
| 25 kolo | 05.09.2016 | FC Foncorda | - | FC Notor | 1 | : | 1 |
| 26 kolo | 07.09.2016 | MŠK B.Bystrica | - | FC Foncorda | 1 | : | 6 |
| 27 kolo | 09.09.2016 | FC Foncorda | - | Slavoj Sereď | 0 | : | 1 |
| 28 kolo | 12.09.2016 | Hviezda | - | FC Foncorda | 0 | : | 1 |
| 29 kolo | 14.09.2016 | FC Foncorda | - | FC Lozorno | 1 | : | 2 |
| 30 kolo | 16.09.2016 | AFK Pečky | - | FC Foncorda | 2 | : | 0 |
| NP | Národný pohár | ||||||
| PB | Pohár Brejk | ||||||